โครงสร้างองค์กร กองตรวจสอบภายใน กองกฎหมาย กองการกีฬา กองการต่างประเทศ กองคลัง กองจัดการสาธารณูปโภค พลังงานและสิ่งแวดล้อม กองทรัพยากรบุคคล กองบริการหอพักนักศึกษา กองบริหารงานกลาง กองบริหารงานวิจัย กองป้องกันและรักษาความปลอดภัย กองพัฒนาคุณภาพการศึกษา กองพัฒนานักศึกษาและศิษย์เก่าสัมพันธ์ กองยุทธศาสตร์ กองสื่อสารองค์กร กองอาคารและสถานที่ สถาบันการสอนวิชาศึกษาทั่วไป สถาบันขงจื่อ สถาบันภาษา สถาบันวิจัยความมั่นคงด้านอาหาร พลังงาน และน้ำอนุภูมิภาคลุ่มน้ำโขง สถาบันวิจัยเพื่อพัฒนาสังคม สถาบันวิจัยมะเร็งท่อน้ำดี สถาบันวิจัยยุทธศาสตร์และประสานความร่วมมือเพื่อพัฒนาภาคตะวันออกเฉียงเหนือ สถาบันวิจัยและพัฒนาวิชาชีพครูสำหรับอาเซียน สถาบันวิจัยวิทยาศาสตร์สุขภาพลุ่มน้ำโขง ศูนย์ทรัพย์สินทางปัญญา ศูนย์นวัตกรรมการเรียนการสอน ศูนย์บริหารจัดการทรัพย์สิน ศูนย์จริยธรรมการวิจัยในมนุษย์ ศูนย์ประสานงานโครงการอันเนื่องมาจากพระราชดำริ ศูนย์วัฒนธรรม ศูนย์สัตว์ทดลองภาคตะวันออกเฉียงเหนือ ศูนย์อาเซียนศึกษา สถาบันวิจัยเพื่อพัฒนาสมรรถนะมนุษย์และการเสริมสร้างสุขภาพ สถาบันวิจัยและบริการด้านออทิซึม สถาบันวิจัยและนวัตกรรมวัสดุนาโนเพื่อพลังงาน ศูนย์พิพิธภัณฑ์และแหล่งเรียนรู้ตลอดชีวิต โรงพิมพ์มหาวิทยาลัยขอนแก่น ศูนย์บริหารจัดการด้านโรงแรม ศูนย์บริการสู่ชุมชน ศูนย์สื่อการเรียนรู้ อุทยานวิทยาศาสตร์ สถาบันวิจัยทรัพยากรน้ำใต้ดิน
